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Y染色體是男性特有的染色體，Y染色體的遺傳，遵循的是父系遺傳，也就是父親會將自己的Y染色體遺傳給兒子，而不可能是女兒，且父親和兒子的Y染色體分型結果完全一致。只要是來自于同一個爺爺，所有的男性后代的Y-STR分型一致。因此，檢測Y-STR，可以用來鑒定爺孫和叔侄關系。
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